大部制改革方案中鐵道部被裁撤，組建中國(guó)鐵路總公司。公眾普遍關(guān)心的是兩個(gè)問(wèn)題：一是鐵道部2.6萬(wàn)億元的負(fù)債怎么辦？二是鐵路票價(jià)是否會(huì)提高？第一個(gè)問(wèn)題官方回應(yīng)為：負(fù)債全部由中國(guó)鐵路總公司承擔(dān)，不會(huì)由納稅人埋單。第二個(gè)問(wèn)題官方回應(yīng)為：鐵路將實(shí)現(xiàn)市場(chǎng)化運(yùn)營(yíng)，且目前的鐵路票價(jià)是較低的。 

如果把這兩個(gè)問(wèn)題的官方回應(yīng)聯(lián)系在一起，完整答案浮出水面：鐵道部負(fù)債已經(jīng)很高，為防止日本鐵路改革對(duì)國(guó)家財(cái)政形成巨額負(fù)擔(dān)的教訓(xùn)在中國(guó)重演，政府決定甩包袱，將負(fù)債轉(zhuǎn)入企業(yè)性質(zhì)的中國(guó)鐵路總公司。中國(guó)鐵路總公司如何償還負(fù)債？對(duì)鐵路實(shí)行市場(chǎng)化運(yùn)營(yíng)，提高票價(jià)至市場(chǎng)水平。即負(fù)債由鐵路乘客埋單。 

但問(wèn)題是，中國(guó)鐵路能市場(chǎng)化運(yùn)營(yíng)嗎？首先，在前期鐵路建設(shè)過(guò)程中，國(guó)家財(cái)政撥付了大量資金，如2012年中央財(cái)政就劃撥鐵路建設(shè)300億元，實(shí)際上這是由中國(guó)納稅人支付的。其次，中國(guó)鐵路總公司將成為鐵路市場(chǎng)上的壟斷經(jīng)營(yíng)者，市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)環(huán)境并未形成，市場(chǎng)準(zhǔn)入處于封閉狀態(tài)，又何來(lái)市場(chǎng)定價(jià)？再者，鐵路運(yùn)營(yíng)對(duì)國(guó)家經(jīng)濟(jì)活動(dòng)有重要的支撐作用，貨運(yùn)票價(jià)提高將增加物流成本，降低行業(yè)競(jìng)爭(zhēng)力（如煤炭）。 

要市場(chǎng)化運(yùn)營(yíng)，中國(guó)鐵路應(yīng)由建運(yùn)合一改革為建運(yùn)分離模式。這是在日本、韓國(guó)、德國(guó)和世界上許多地區(qū)廣泛運(yùn)用的模式。國(guó)家鐵路局仍然負(fù)責(zé)鐵路規(guī)劃和建設(shè)且不以盈利為目的。鐵路建成后，以建設(shè)成本轉(zhuǎn)讓或租賃給鐵路運(yùn)營(yíng)公司。鐵路運(yùn)營(yíng)公司負(fù)責(zé)鐵路運(yùn)營(yíng)維護(hù)，并制定票價(jià)。而租賃招標(biāo)可采用票價(jià)低者得的模式，使鐵路運(yùn)營(yíng)公司展開(kāi)市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)。